Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Hecw1Q8K4P8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Hecw1Q8K4P8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Hecw1Q8K4P8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Hecw1Q8K4P8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Hecw1Q8K4P8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Hecw1Q8K4P8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Hecw1Q8K4P8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Hecw1Q8K4P8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Hecw1Q8K4P8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Hecw1Q8K4P8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Hecw1Q8K4P8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Hecw1Q8K4P8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Hecw1Q8K4P8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Hecw1Q8K4P8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Hecw1Q8K4P8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Hecw1Q8K4P8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Hecw1Q8K4P8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Hecw1Q8K4P8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Hecw1Q8K4P8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
Hecw1Q8K4P8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Hecw1Q8K4P8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Hecw1Q8K4P8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Hecw1Q8K4P8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Hecw1Q8K4P8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Hecw1Q8K4P8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Hecw1Q8K4P8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Hecw1Q8K4P8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Hecw1Q8K4P8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Hecw1Q8K4P8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Hecw1Q8K4P8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Hecw1Q8K4P8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Hecw1Q8K4P8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Hecw1Q8K4P8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Hecw1Q8K4P8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Hecw1Q8K4P8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Hecw1Q8K4P8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Hecw1Q8K4P8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Hecw1Q8K4P8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Hecw1Q8K4P8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Hecw1Q8K4P8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Hecw1Q8K4P8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Hecw1Q8K4P8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Hecw1Q8K4P8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Hecw1Q8K4P8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Hecw1Q8K4P8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Hecw1Q8K4P8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Hecw1Q8K4P8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Hecw1Q8K4P8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Hecw1Q8K4P8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Hecw1Q8K4P8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Hecw1Q8K4P8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Hecw1Q8K4P8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Hecw1Q8K4P8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Hecw1Q8K4P8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Hecw1Q8K4P8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Hecw1Q8K4P8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Hecw1Q8K4P8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Hecw1Q8K4P8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Hecw1Q8K4P8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Hecw1Q8K4P8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Hecw1Q8K4P8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Hecw1Q8K4P8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Hecw1Q8K4P8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Hecw1Q8K4P8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Hecw1Q8K4P8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Hecw1Q8K4P8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Hecw1Q8K4P8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Hecw1Q8K4P8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Hecw1Q8K4P8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Hecw1Q8K4P8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Hecw1Q8K4P8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Hecw1Q8K4P8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Hecw1Q8K4P8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Hecw1Q8K4P8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Hecw1Q8K4P8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Hecw1Q8K4P8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Hecw1Q8K4P8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Hecw1Q8K4P8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms