Protein–RNA interactions for Protein: Q8K448

Abca5, ATP-binding cassette sub-family A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca5Q8K448 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Abca5Q8K448 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Abca5Q8K448 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Abca5Q8K448 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Abca5Q8K448 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Abca5Q8K448 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Abca5Q8K448 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Abca5Q8K448 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Abca5Q8K448 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Abca5Q8K448 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Abca5Q8K448 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Abca5Q8K448 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Abca5Q8K448 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Abca5Q8K448 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Abca5Q8K448 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Abca5Q8K448 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Abca5Q8K448 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Abca5Q8K448 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Abca5Q8K448 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Abca5Q8K448 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Abca5Q8K448 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Abca5Q8K448 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Abca5Q8K448 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Abca5Q8K448 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Abca5Q8K448 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Abca5Q8K448 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Abca5Q8K448 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Abca5Q8K448 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Abca5Q8K448 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Abca5Q8K448 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Abca5Q8K448 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Abca5Q8K448 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Abca5Q8K448 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Abca5Q8K448 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Abca5Q8K448 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Abca5Q8K448 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Abca5Q8K448 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Abca5Q8K448 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Abca5Q8K448 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Abca5Q8K448 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Abca5Q8K448 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Abca5Q8K448 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abca5Q8K448 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Abca5Q8K448 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Abca5Q8K448 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Abca5Q8K448 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Abca5Q8K448 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Abca5Q8K448 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Abca5Q8K448 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Abca5Q8K448 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Abca5Q8K448 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Abca5Q8K448 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Abca5Q8K448 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abca5Q8K448 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abca5Q8K448 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abca5Q8K448 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abca5Q8K448 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abca5Q8K448 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Abca5Q8K448 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Abca5Q8K448 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abca5Q8K448 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abca5Q8K448 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Abca5Q8K448 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abca5Q8K448 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abca5Q8K448 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abca5Q8K448 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abca5Q8K448 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abca5Q8K448 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abca5Q8K448 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Abca5Q8K448 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Abca5Q8K448 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Abca5Q8K448 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abca5Q8K448 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abca5Q8K448 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abca5Q8K448 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abca5Q8K448 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abca5Q8K448 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abca5Q8K448 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abca5Q8K448 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abca5Q8K448 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Abca5Q8K448 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abca5Q8K448 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Abca5Q8K448 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abca5Q8K448 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abca5Q8K448 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abca5Q8K448 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abca5Q8K448 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abca5Q8K448 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abca5Q8K448 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Abca5Q8K448 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Abca5Q8K448 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abca5Q8K448 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abca5Q8K448 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abca5Q8K448 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abca5Q8K448 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Abca5Q8K448 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Abca5Q8K448 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abca5Q8K448 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abca5Q8K448 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abca5Q8K448 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms