Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp45Q8K387 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp45Q8K387 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp45Q8K387 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp45Q8K387 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms