Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsl1Q8K305 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsl1Q8K305 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsl1Q8K305 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsl1Q8K305 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsl1Q8K305 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms