Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I1

Fntb, Protein farnesyltransferase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FntbQ8K2I1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FntbQ8K2I1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FntbQ8K2I1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FntbQ8K2I1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FntbQ8K2I1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FntbQ8K2I1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FntbQ8K2I1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FntbQ8K2I1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FntbQ8K2I1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FntbQ8K2I1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FntbQ8K2I1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FntbQ8K2I1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FntbQ8K2I1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FntbQ8K2I1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FntbQ8K2I1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FntbQ8K2I1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FntbQ8K2I1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FntbQ8K2I1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FntbQ8K2I1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FntbQ8K2I1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FntbQ8K2I1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FntbQ8K2I1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms