Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf3Q8K268 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcf3Q8K268 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcf3Q8K268 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcf3Q8K268 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcf3Q8K268 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms