Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R3

Pnpt1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpt1Q8K1R3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pnpt1Q8K1R3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pnpt1Q8K1R3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pnpt1Q8K1R3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnpt1Q8K1R3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pnpt1Q8K1R3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pnpt1Q8K1R3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pnpt1Q8K1R3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pnpt1Q8K1R3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pnpt1Q8K1R3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pnpt1Q8K1R3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pnpt1Q8K1R3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pnpt1Q8K1R3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pnpt1Q8K1R3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnpt1Q8K1R3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnpt1Q8K1R3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnpt1Q8K1R3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnpt1Q8K1R3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnpt1Q8K1R3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnpt1Q8K1R3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pnpt1Q8K1R3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pnpt1Q8K1R3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pnpt1Q8K1R3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pnpt1Q8K1R3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms