Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1K4

Cenpi, Centromere protein I, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpiQ8K1K4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpiQ8K1K4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpiQ8K1K4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpiQ8K1K4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpiQ8K1K4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpiQ8K1K4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpiQ8K1K4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpiQ8K1K4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpiQ8K1K4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CenpiQ8K1K4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpiQ8K1K4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpiQ8K1K4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CenpiQ8K1K4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CenpiQ8K1K4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpiQ8K1K4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpiQ8K1K4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpiQ8K1K4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpiQ8K1K4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpiQ8K1K4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpiQ8K1K4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpiQ8K1K4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpiQ8K1K4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpiQ8K1K4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpiQ8K1K4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpiQ8K1K4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpiQ8K1K4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpiQ8K1K4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpiQ8K1K4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpiQ8K1K4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpiQ8K1K4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms