Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0M7

D630039A03Rik, RIKEN cDNA D630039A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D630039A03RikQ8K0M7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
D630039A03RikQ8K0M7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
D630039A03RikQ8K0M7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
D630039A03RikQ8K0M7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
D630039A03RikQ8K0M7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
D630039A03RikQ8K0M7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms