Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TwnkQ8CIW5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TwnkQ8CIW5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TwnkQ8CIW5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TwnkQ8CIW5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TwnkQ8CIW5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms