Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIN6

Celf3, CUGBP Elav-like family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf3Q8CIN6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Celf3Q8CIN6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Celf3Q8CIN6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Celf3Q8CIN6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Celf3Q8CIN6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Celf3Q8CIN6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Celf3Q8CIN6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Celf3Q8CIN6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Celf3Q8CIN6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Celf3Q8CIN6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Celf3Q8CIN6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Celf3Q8CIN6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Celf3Q8CIN6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Celf3Q8CIN6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Celf3Q8CIN6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Celf3Q8CIN6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Celf3Q8CIN6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Celf3Q8CIN6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Celf3Q8CIN6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Celf3Q8CIN6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Celf3Q8CIN6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Celf3Q8CIN6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Celf3Q8CIN6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Celf3Q8CIN6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Celf3Q8CIN6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Celf3Q8CIN6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Celf3Q8CIN6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Celf3Q8CIN6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Celf3Q8CIN6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Celf3Q8CIN6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Celf3Q8CIN6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Celf3Q8CIN6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Celf3Q8CIN6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Celf3Q8CIN6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Celf3Q8CIN6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Celf3Q8CIN6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Celf3Q8CIN6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Celf3Q8CIN6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Celf3Q8CIN6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms