Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CopaQ8CIE6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CopaQ8CIE6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CopaQ8CIE6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CopaQ8CIE6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CopaQ8CIE6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CopaQ8CIE6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CopaQ8CIE6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CopaQ8CIE6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CopaQ8CIE6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CopaQ8CIE6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CopaQ8CIE6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CopaQ8CIE6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CopaQ8CIE6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CopaQ8CIE6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CopaQ8CIE6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CopaQ8CIE6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CopaQ8CIE6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CopaQ8CIE6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CopaQ8CIE6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CopaQ8CIE6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms