Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh4a1Q8CHT0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aldh4a1Q8CHT0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh4a1Q8CHT0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh4a1Q8CHT0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh4a1Q8CHT0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh4a1Q8CHT0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh4a1Q8CHT0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh4a1Q8CHT0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh4a1Q8CHT0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aldh4a1Q8CHT0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aldh4a1Q8CHT0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh4a1Q8CHT0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh4a1Q8CHT0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh4a1Q8CHT0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh4a1Q8CHT0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aldh4a1Q8CHT0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aldh4a1Q8CHT0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aldh4a1Q8CHT0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aldh4a1Q8CHT0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh4a1Q8CHT0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh4a1Q8CHT0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh4a1Q8CHT0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh4a1Q8CHT0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh4a1Q8CHT0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh4a1Q8CHT0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh4a1Q8CHT0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh4a1Q8CHT0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms