Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Cc2d2aQ8CFW7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Cc2d2aQ8CFW7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Cc2d2aQ8CFW7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Cc2d2aQ8CFW7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Cc2d2aQ8CFW7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Cc2d2aQ8CFW7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Cc2d2aQ8CFW7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Cc2d2aQ8CFW7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Cc2d2aQ8CFW7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Cc2d2aQ8CFW7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Cc2d2aQ8CFW7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Cc2d2aQ8CFW7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Cc2d2aQ8CFW7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Cc2d2aQ8CFW7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Cc2d2aQ8CFW7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Cc2d2aQ8CFW7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Cc2d2aQ8CFW7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Cc2d2aQ8CFW7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
Cc2d2aQ8CFW7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Cc2d2aQ8CFW7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Cc2d2aQ8CFW7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Cc2d2aQ8CFW7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
Cc2d2aQ8CFW7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Cc2d2aQ8CFW7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Cc2d2aQ8CFW7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Cc2d2aQ8CFW7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Cc2d2aQ8CFW7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Cc2d2aQ8CFW7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Cc2d2aQ8CFW7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Cc2d2aQ8CFW7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Cc2d2aQ8CFW7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Cc2d2aQ8CFW7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Cc2d2aQ8CFW7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
Cc2d2aQ8CFW7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Cc2d2aQ8CFW7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Cc2d2aQ8CFW7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Cc2d2aQ8CFW7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
Cc2d2aQ8CFW7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Cc2d2aQ8CFW7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Cc2d2aQ8CFW7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Cc2d2aQ8CFW7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Cc2d2aQ8CFW7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Cc2d2aQ8CFW7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Cc2d2aQ8CFW7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Cc2d2aQ8CFW7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Cc2d2aQ8CFW7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Cc2d2aQ8CFW7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Cc2d2aQ8CFW7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Cc2d2aQ8CFW7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Cc2d2aQ8CFW7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Cc2d2aQ8CFW7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
Cc2d2aQ8CFW7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Cc2d2aQ8CFW7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Cc2d2aQ8CFW7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.17
Cc2d2aQ8CFW7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Cc2d2aQ8CFW7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
Cc2d2aQ8CFW7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Cc2d2aQ8CFW7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Cc2d2aQ8CFW7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Cc2d2aQ8CFW7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Cc2d2aQ8CFW7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Cc2d2aQ8CFW7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Cc2d2aQ8CFW7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Cc2d2aQ8CFW7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Cc2d2aQ8CFW7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Cc2d2aQ8CFW7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
Cc2d2aQ8CFW7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Cc2d2aQ8CFW7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
Cc2d2aQ8CFW7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
Cc2d2aQ8CFW7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC41■■■■■ 4.15
Cc2d2aQ8CFW7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC41■■■■■ 4.15
Cc2d2aQ8CFW7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
Cc2d2aQ8CFW7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
Cc2d2aQ8CFW7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Cc2d2aQ8CFW7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Cc2d2aQ8CFW7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms