Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hpf1Q8CFE2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hpf1Q8CFE2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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