Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramef8Q8CE24 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef8Q8CE24 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Pramef8Q8CE24 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef8Q8CE24 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef8Q8CE24 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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