Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf31Q8CCF0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf31Q8CCF0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf31Q8CCF0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf31Q8CCF0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf31Q8CCF0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf31Q8CCF0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prpf31Q8CCF0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf31Q8CCF0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf31Q8CCF0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf31Q8CCF0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf31Q8CCF0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms