Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slfn5Q8CBA2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slfn5Q8CBA2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slfn5Q8CBA2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slfn5Q8CBA2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slfn5Q8CBA2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slfn5Q8CBA2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slfn5Q8CBA2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slfn5Q8CBA2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slfn5Q8CBA2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slfn5Q8CBA2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slfn5Q8CBA2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slfn5Q8CBA2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfn5Q8CBA2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn5Q8CBA2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn5Q8CBA2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn5Q8CBA2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn5Q8CBA2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn5Q8CBA2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Slfn5Q8CBA2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn5Q8CBA2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn5Q8CBA2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms