Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc186Q8C9S4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc186Q8C9S4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc186Q8C9S4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms