Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K3

Srsf12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf12Q8C8K3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf12Q8C8K3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Srsf12Q8C8K3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf12Q8C8K3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms