Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp20Q8C6M1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp20Q8C6M1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp20Q8C6M1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp20Q8C6M1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp20Q8C6M1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp20Q8C6M1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp20Q8C6M1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp20Q8C6M1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp20Q8C6M1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp20Q8C6M1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp20Q8C6M1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp20Q8C6M1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp20Q8C6M1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp20Q8C6M1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp20Q8C6M1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp20Q8C6M1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp20Q8C6M1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp20Q8C6M1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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