Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3Q9

Casp9, Caspase-9, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp9Q8C3Q9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp9Q8C3Q9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp9Q8C3Q9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp9Q8C3Q9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp9Q8C3Q9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp9Q8C3Q9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp9Q8C3Q9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp9Q8C3Q9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp9Q8C3Q9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp9Q8C3Q9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms