Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1S0

Med19, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 19, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med19Q8C1S0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med19Q8C1S0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med19Q8C1S0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Med19Q8C1S0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Med19Q8C1S0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med19Q8C1S0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med19Q8C1S0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Med19Q8C1S0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med19Q8C1S0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med19Q8C1S0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med19Q8C1S0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med19Q8C1S0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Med19Q8C1S0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms