Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Strip1Q8C079 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Strip1Q8C079 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Strip1Q8C079 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Strip1Q8C079 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Strip1Q8C079 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Strip1Q8C079 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Strip1Q8C079 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Strip1Q8C079 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Strip1Q8C079 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Strip1Q8C079 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Strip1Q8C079 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Strip1Q8C079 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Strip1Q8C079 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Strip1Q8C079 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Strip1Q8C079 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Strip1Q8C079 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Strip1Q8C079 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Strip1Q8C079 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Strip1Q8C079 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Strip1Q8C079 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Strip1Q8C079 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Strip1Q8C079 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Strip1Q8C079 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Strip1Q8C079 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Strip1Q8C079 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Strip1Q8C079 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Strip1Q8C079 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Strip1Q8C079 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Strip1Q8C079 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Strip1Q8C079 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Strip1Q8C079 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Strip1Q8C079 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Strip1Q8C079 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Strip1Q8C079 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Strip1Q8C079 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Strip1Q8C079 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Strip1Q8C079 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Strip1Q8C079 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Strip1Q8C079 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Strip1Q8C079 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Strip1Q8C079 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Strip1Q8C079 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Strip1Q8C079 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Strip1Q8C079 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Strip1Q8C079 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Strip1Q8C079 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Strip1Q8C079 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Strip1Q8C079 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Strip1Q8C079 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Strip1Q8C079 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Strip1Q8C079 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Strip1Q8C079 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Strip1Q8C079 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Strip1Q8C079 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Strip1Q8C079 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Strip1Q8C079 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Strip1Q8C079 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Strip1Q8C079 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Strip1Q8C079 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Strip1Q8C079 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Strip1Q8C079 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms