Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec22cQ8BXT9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec22cQ8BXT9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec22cQ8BXT9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec22cQ8BXT9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec22cQ8BXT9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sec22cQ8BXT9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms