Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctdsp2Q8BX07 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdsp2Q8BX07 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Ctdsp2Q8BX07 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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