Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp38Q8BW70 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp38Q8BW70 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp38Q8BW70 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp38Q8BW70 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp38Q8BW70 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp38Q8BW70 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp38Q8BW70 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp38Q8BW70 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp38Q8BW70 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp38Q8BW70 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp38Q8BW70 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp38Q8BW70 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp38Q8BW70 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp38Q8BW70 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp38Q8BW70 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp38Q8BW70 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms