Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rd3Q8BRE0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rd3Q8BRE0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rd3Q8BRE0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rd3Q8BRE0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rd3Q8BRE0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms