Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab11fip4Q8BQP8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab11fip4Q8BQP8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rab11fip4Q8BQP8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip4Q8BQP8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip4Q8BQP8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip4Q8BQP8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip4Q8BQP8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip4Q8BQP8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab11fip4Q8BQP8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab11fip4Q8BQP8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab11fip4Q8BQP8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab11fip4Q8BQP8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11fip4Q8BQP8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11fip4Q8BQP8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip4Q8BQP8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip4Q8BQP8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip4Q8BQP8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip4Q8BQP8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab11fip4Q8BQP8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab11fip4Q8BQP8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip4Q8BQP8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip4Q8BQP8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip4Q8BQP8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip4Q8BQP8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip4Q8BQP8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab11fip4Q8BQP8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab11fip4Q8BQP8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms