Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd55Q8BLD6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd55Q8BLD6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd55Q8BLD6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms