Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX0

4933402J07Rik, RIKEN cDNA 4933402J07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402J07RikQ8BHX0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933402J07RikQ8BHX0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933402J07RikQ8BHX0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933402J07RikQ8BHX0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933402J07RikQ8BHX0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933402J07RikQ8BHX0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933402J07RikQ8BHX0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933402J07RikQ8BHX0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933402J07RikQ8BHX0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933402J07RikQ8BHX0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933402J07RikQ8BHX0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933402J07RikQ8BHX0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933402J07RikQ8BHX0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933402J07RikQ8BHX0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933402J07RikQ8BHX0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933402J07RikQ8BHX0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933402J07RikQ8BHX0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
4933402J07RikQ8BHX0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
4933402J07RikQ8BHX0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933402J07RikQ8BHX0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933402J07RikQ8BHX0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933402J07RikQ8BHX0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
4933402J07RikQ8BHX0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933402J07RikQ8BHX0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933402J07RikQ8BHX0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933402J07RikQ8BHX0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402J07RikQ8BHX0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402J07RikQ8BHX0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402J07RikQ8BHX0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402J07RikQ8BHX0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402J07RikQ8BHX0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402J07RikQ8BHX0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402J07RikQ8BHX0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
4933402J07RikQ8BHX0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933402J07RikQ8BHX0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms