Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg4dQ8BGV9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4dQ8BGV9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg4dQ8BGV9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg4dQ8BGV9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms