Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pknox2Q8BG99 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pknox2Q8BG99 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pknox2Q8BG99 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pknox2Q8BG99 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms