Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt12Q8BG71 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt12Q8BG71 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt12Q8BG71 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms