Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Necab1Q8BG18 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Necab1Q8BG18 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Necab1Q8BG18 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Necab1Q8BG18 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Necab1Q8BG18 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Necab1Q8BG18 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Necab1Q8BG18 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Necab1Q8BG18 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms