Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg4cQ811C2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4cQ811C2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg4cQ811C2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg4cQ811C2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms