Protein–RNA interactions for Protein: Q810I2

Trim50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim50Q810I2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim50Q810I2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim50Q810I2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim50Q810I2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim50Q810I2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim50Q810I2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim50Q810I2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim50Q810I2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim50Q810I2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim50Q810I2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim50Q810I2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim50Q810I2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim50Q810I2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim50Q810I2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim50Q810I2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim50Q810I2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim50Q810I2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim50Q810I2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim50Q810I2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim50Q810I2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms