Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IfneQ80ZF2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IfneQ80ZF2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IfneQ80ZF2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IfneQ80ZF2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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