Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Kdm5bQ80Y84 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Kdm5bQ80Y84 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Kdm5bQ80Y84 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Kdm5bQ80Y84 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,37■■■■□ 3,41
Kdm5bQ80Y84 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Kdm5bQ80Y84 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36,36■■■■□ 3,41
Kdm5bQ80Y84 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Kdm5bQ80Y84 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36,34■■■■□ 3,41
Kdm5bQ80Y84 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Kdm5bQ80Y84 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Kdm5bQ80Y84 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36,34■■■■□ 3,41
Kdm5bQ80Y84 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,33■■■■□ 3,41
Kdm5bQ80Y84 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Kdm5bQ80Y84 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,41
Kdm5bQ80Y84 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Kdm5bQ80Y84 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Kdm5bQ80Y84 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Kdm5bQ80Y84 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36,32■■■■□ 3,4
Kdm5bQ80Y84 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Kdm5bQ80Y84 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Kdm5bQ80Y84 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Kdm5bQ80Y84 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36,29■■■■□ 3,4
Kdm5bQ80Y84 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36,29■■■■□ 3,4
Kdm5bQ80Y84 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36,29■■■■□ 3,4
Kdm5bQ80Y84 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36,29■■■■□ 3,4
Kdm5bQ80Y84 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36,28■■■■□ 3,4
Kdm5bQ80Y84 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Kdm5bQ80Y84 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,25■■■■□ 3,39
Kdm5bQ80Y84 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Kdm5bQ80Y84 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Kdm5bQ80Y84 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36,24■■■■□ 3,39
Kdm5bQ80Y84 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36,23■■■■□ 3,39
Kdm5bQ80Y84 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36,23■■■■□ 3,39
Kdm5bQ80Y84 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,23■■■■□ 3,39
Kdm5bQ80Y84 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,22■■■■□ 3,39
Kdm5bQ80Y84 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Kdm5bQ80Y84 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Kdm5bQ80Y84 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Kdm5bQ80Y84 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Kdm5bQ80Y84 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,19■■■■□ 3,38
Kdm5bQ80Y84 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36,19■■■■□ 3,38
Kdm5bQ80Y84 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Kdm5bQ80Y84 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC36,18■■■■□ 3,38
Kdm5bQ80Y84 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36,18■■■■□ 3,38
Kdm5bQ80Y84 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Kdm5bQ80Y84 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36,17■■■■□ 3,38
Kdm5bQ80Y84 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Kdm5bQ80Y84 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Kdm5bQ80Y84 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Kdm5bQ80Y84 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Kdm5bQ80Y84 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,14■■■■□ 3,38
Kdm5bQ80Y84 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC36,13■■■■□ 3,38
Kdm5bQ80Y84 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,38
Kdm5bQ80Y84 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Kdm5bQ80Y84 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Kdm5bQ80Y84 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Kdm5bQ80Y84 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Kdm5bQ80Y84 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36,09■■■■□ 3,37
Kdm5bQ80Y84 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Kdm5bQ80Y84 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Kdm5bQ80Y84 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Kdm5bQ80Y84 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Kdm5bQ80Y84 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Kdm5bQ80Y84 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Kdm5bQ80Y84 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,37
Kdm5bQ80Y84 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Kdm5bQ80Y84 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Kdm5bQ80Y84 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,05■■■■□ 3,36
Kdm5bQ80Y84 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36,04■■■■□ 3,36
Kdm5bQ80Y84 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36,03■■■■□ 3,36
Kdm5bQ80Y84 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Kdm5bQ80Y84 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Kdm5bQ80Y84 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC36,02■■■■□ 3,36
Kdm5bQ80Y84 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Kdm5bQ80Y84 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC36,01■■■■□ 3,36
Kdm5bQ80Y84 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,01■■■■□ 3,36
Kdm5bQ80Y84 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,35
Kdm5bQ80Y84 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3,35
Kdm5bQ80Y84 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Kdm5bQ80Y84 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Kdm5bQ80Y84 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Kdm5bQ80Y84 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Kdm5bQ80Y84 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Kdm5bQ80Y84 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC35,98■■■■□ 3,35
Kdm5bQ80Y84 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Kdm5bQ80Y84 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Kdm5bQ80Y84 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Kdm5bQ80Y84 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Kdm5bQ80Y84 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC35,96■■■■□ 3,35
Kdm5bQ80Y84 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Kdm5bQ80Y84 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC35,94■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35,94■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35,93■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC35,93■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC35,93■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC35,93■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC35,93■■■■□ 3,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,1 ms