Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ell3Q80VR2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ell3Q80VR2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ell3Q80VR2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms