Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sestd1Q80UK0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sestd1Q80UK0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sestd1Q80UK0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sestd1Q80UK0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sestd1Q80UK0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sestd1Q80UK0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sestd1Q80UK0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Sestd1Q80UK0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sestd1Q80UK0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sestd1Q80UK0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sestd1Q80UK0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sestd1Q80UK0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sestd1Q80UK0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sestd1Q80UK0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sestd1Q80UK0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sestd1Q80UK0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sestd1Q80UK0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sestd1Q80UK0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms