Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf8Q80TJ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf8Q80TJ7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf8Q80TJ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf8Q80TJ7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf8Q80TJ7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf8Q80TJ7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf8Q80TJ7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf8Q80TJ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf8Q80TJ7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf8Q80TJ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phf8Q80TJ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf8Q80TJ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Phf8Q80TJ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf8Q80TJ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Phf8Q80TJ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Phf8Q80TJ7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms