Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Lca5Q80ST9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lca5Q80ST9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lca5Q80ST9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lca5Q80ST9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lca5Q80ST9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lca5Q80ST9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lca5Q80ST9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lca5Q80ST9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lca5Q80ST9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lca5Q80ST9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lca5Q80ST9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120 ms