Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lamp3Q7TST5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lamp3Q7TST5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms