Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ClmQ7TSN2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ClmQ7TSN2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ClmQ7TSN2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ClmQ7TSN2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms