Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Ctdp1Q7TSG2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ctdp1Q7TSG2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctdp1Q7TSG2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms