Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN60

Tmc6, Transmembrane channel-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc6Q7TN60 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc6Q7TN60 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc6Q7TN60 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc6Q7TN60 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc6Q7TN60 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc6Q7TN60 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc6Q7TN60 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc6Q7TN60 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc6Q7TN60 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc6Q7TN60 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmc6Q7TN60 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc6Q7TN60 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc6Q7TN60 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmc6Q7TN60 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmc6Q7TN60 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc6Q7TN60 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc6Q7TN60 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc6Q7TN60 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc6Q7TN60 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc6Q7TN60 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc6Q7TN60 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc6Q7TN60 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc6Q7TN60 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmc6Q7TN60 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmc6Q7TN60 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmc6Q7TN60 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmc6Q7TN60 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms