Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GypcQ78HU7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GypcQ78HU7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GypcQ78HU7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GypcQ78HU7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms