Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nup188Q6ZQH8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup188Q6ZQH8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup188Q6ZQH8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup188Q6ZQH8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup188Q6ZQH8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup188Q6ZQH8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup188Q6ZQH8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup188Q6ZQH8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup188Q6ZQH8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup188Q6ZQH8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup188Q6ZQH8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup188Q6ZQH8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nup188Q6ZQH8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup188Q6ZQH8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup188Q6ZQH8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup188Q6ZQH8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup188Q6ZQH8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup188Q6ZQH8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup188Q6ZQH8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup188Q6ZQH8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup188Q6ZQH8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup188Q6ZQH8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup188Q6ZQH8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup188Q6ZQH8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nup188Q6ZQH8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nup188Q6ZQH8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nup188Q6ZQH8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup188Q6ZQH8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup188Q6ZQH8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup188Q6ZQH8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup188Q6ZQH8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup188Q6ZQH8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup188Q6ZQH8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup188Q6ZQH8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup188Q6ZQH8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup188Q6ZQH8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup188Q6ZQH8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup188Q6ZQH8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup188Q6ZQH8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup188Q6ZQH8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup188Q6ZQH8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup188Q6ZQH8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup188Q6ZQH8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup188Q6ZQH8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup188Q6ZQH8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup188Q6ZQH8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup188Q6ZQH8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup188Q6ZQH8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup188Q6ZQH8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup188Q6ZQH8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup188Q6ZQH8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup188Q6ZQH8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nup188Q6ZQH8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms