Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Efr3bQ6ZQ18 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Efr3bQ6ZQ18 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efr3bQ6ZQ18 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efr3bQ6ZQ18 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efr3bQ6ZQ18 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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